Από τα προγράμματα του ΕΣΠΑ τη χαμηλότερη απορρόφηση έχουν εκείνα που θα έπρεπε να έχουν την υψηλότερη. Τα πιο χαρακτηριστικά παραδείγματα αποτελούν τα προγράμματα της Ψηφιακής Σύγκλισης (0,10%), της Ανάπτυξης Ανθρωπίνου Δυναμικού (0,39%) και της Διοικητικής Μεταρρύθμισης (0,46%).
Σημειώνεται ότι οι εκπρόσωποι της Ευρωπαϊκής Επιτροπής θα ασκήσουν κριτική τόσο για τη χαμηλή απορρόφηση (για την οποία δεν ευθύνεται η παρούσα αλλά η προηγούμενη κυβέρνηση) όσο και για το γεγονός ότι το τρίτο Κοινοτικό Πλαίσιο Στήριξης (Γ΄ ΚΠΣ) έχει πολλές υπερδεσμεύσεις. Δηλαδή έχουν υπογραφεί συμβάσεις για έργα κατά 6 δισ. ευρώ περισσότερα από τους πόρους του Γ΄ ΚΠΣ. Ενα μέρος του ποσού αυτού αφορά τα λεγόμενα έργα-γέφυρες (που άρχισαν επί Γ΄ ΚΠΣ και συνεχίζονται επί ΕΣΠΑ), αλλά το υπόλοιπο μέρος (το οποίο δεν γνωρίζουν πόσο είναι) αφορά υπερδεσμεύσεις που δεν καλύπτονται από κοινοτικούς πόρους. Αρα ή θα πρέπει να χρηματοδοτηθούν με εθνικούς πόρους (που δεν υπάρχουν) ή τα έργα θα «μετατραπούν» σε έργα-γέφυρες ή δεν θα εκτελεστούν, με ό,τι αυτό συνεπάγεται.